Misi adalah apa yang kita lakukan untuk mencapai visi tersebut. Misi MTs NU Raum adalah sebagai berikut:
- Menyelenggarakan pendidikan dengan pembelajaran yang efektif dan berkualitas dalam pencapaian prestasi akademik
- Menyelenggarakan pendidikan bernuansa Islam dengan menciptakan lingkungan yang agamis di madrasah yang bernuansa ahlussunah wal jamaah.
- Menyelenggarakan pembinaan dan pelatihan life skill untuk menggali dan menumbuhkembangkan minat dan bakat peserta didik yang berpotensi tinggi agar dapat berkembang secara optimal
- Menumbuhkembangkan budaya akhlakul karimah pada seluruh warga madrasah
